Если вопрос еще актуален для кого-то, то конечно нужно было делать уклон и вода действительно может за счет поверхностного натяжения затекать под крышу, в таком случае можно по ободку профнастила у самого торца пройтись термопистолетом, сам не пробовал, но может поможет, (я из 2018-го, термоклей наше все)
А вообще если проблема в уплотнительных кольцах на шурупах, то тут думать нужно, может в процессе монтажа листы повреждены, нужно внимательно смотреть.